在减少消毒副产品危害性方面，小型医院污水处理设备能够保证卤代烃的生产量减少，若水中余氯消耗殆尽，卤代烃含量将不再发生变化。而且总卤代烃、一溴二氯甲烷、三氯甲烷等浓度都会降低，使其对环境及人体健康的持久、潜在危害得以减少。因此，小型医院污水处理设备工艺的利用既可保证消毒剂用量的降低，也使消毒副产品对人体健康及生态环境带来的影响最大程度的减少，在医院污水处理中可充分利用。